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風(fēng)口已來?從20家AI制藥公司中看趨勢~

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Meta收購Manus AI的消息,像一顆深水炸彈砸進(jìn)了原本就不平靜的AI圈。

過去一年,生物醫(yī)藥行業(yè)的AI進(jìn)化也在悄然劇變,AI不再是實(shí)驗室里花里胡哨的噱頭,搖身一變成了大藥企紛紛爭搶的香餑餑。

嗅覺靈敏的MNC們,早就停止了嘴炮,并用腳投票。禮來、諾華、阿斯利康已經(jīng)簽下了一張張數(shù)億美金的支票。

邏輯很簡單,與其坐等奇跡,不如直接買未來入場券。

以下20家AI制藥公司在這場生產(chǎn)力革命中表現(xiàn)最搶眼,大廠看了都要遞名片的,值得您一起關(guān)注關(guān)注。


胖貓把幾個進(jìn)入深水區(qū)的AI公司,展開跟大家分享學(xué)習(xí)下。

01

小分子AI公司打 GPCR

Deep Apple Therapeutics ——捕捉“中間結(jié)構(gòu)狀態(tài)”的能力

傳統(tǒng)GPCR藥物研發(fā)常基于靜態(tài)晶體結(jié)構(gòu)(激活或失活態(tài))。然而,GPCR是高度動態(tài)的蛋白。

Deep Apple的突破在于利用整體冷凍電鏡(Cryo-EM)技術(shù)結(jié)合AI平臺,捕捉到 GPCR在信號傳導(dǎo)過程中轉(zhuǎn)瞬即逝的“中間結(jié)構(gòu)狀態(tài)”,這些中間狀態(tài)往往暴露出傳統(tǒng)方法看不到的結(jié)合口袋(隱蔽口袋)。

這意味著 Deep Apple 可以針對這些“低豐度構(gòu)象”設(shè)計藥物,從而攻克傳統(tǒng)方法認(rèn)為“不可成藥”的靶點(diǎn)。

通過冷凍電鏡獲得這些獨(dú)特 GPCR 結(jié)構(gòu)后,Deep Apple 完全依賴虛擬篩選,利用 Orchard.ai? 平臺進(jìn)行大規(guī)模Docking。

同時使用專有的基于物理的評分算法,在數(shù)以億計的虛擬化合物庫中尋找能與特定 GPCR 中間構(gòu)象完美結(jié)合的分子。


GPCR 的藥物研發(fā)通常非常耗時,尤其是在先導(dǎo)化合物優(yōu)化階段。但Deep Apple 聲稱其平臺能在 12 個月或更短時間內(nèi)完成從靶點(diǎn)識別到先導(dǎo)化合物優(yōu)化的全過程。

相比下,傳統(tǒng)流程通常需要 2.5 年甚至更長時間。這種速度優(yōu)勢在競爭激烈的 GPCR 賽道(如代謝疾病、炎癥、中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾病)中至關(guān)重要。

由于能夠看到 GPCR 的動態(tài)變化和中間狀態(tài),Deep Apple 有潛力開發(fā)出具有更精準(zhǔn)生物學(xué)功能的調(diào)節(jié)劑(如變構(gòu)調(diào)節(jié)劑),這比傳統(tǒng)的正構(gòu)位點(diǎn)抑制劑或激動劑可能具有更好選擇性和更少副作用。

02

蛋白AI,跨越血腦屏障

Manifold Bio ——跨越血腦屏障

這是一家非常有趣的生物技術(shù)公司,它從哈佛大學(xué)遺傳學(xué)泰斗 George Church 的實(shí)驗室衍生出來的。

Manifold Bio 的核心技術(shù)是他們發(fā)明了一種給蛋白藥物打上“條形碼”的技術(shù),從而能夠在活體動物體內(nèi)(In Vivo)同時測試數(shù)十種甚至上百種藥物,打破了傳統(tǒng)藥物研發(fā)中“一次只能測一個”的瓶頸。

傳統(tǒng)的蛋白藥物(如抗體)研發(fā)中,流程通常是這樣的:

第1步(體外):在培養(yǎng)皿(In Vitro)里篩選成千上萬個候選分子,看誰能結(jié)合靶蛋白。

第2步(體內(nèi)篩選): 挑出最好的幾個,(因為動物實(shí)驗太貴、太慢,不能全測), 把這幾個打入實(shí)驗動物體內(nèi)(In Vivo),看效果和分布。

問題在于培養(yǎng)皿里的結(jié)果往往不能代表體內(nèi)的真實(shí)情況。很多在培養(yǎng)皿里表現(xiàn)完美的藥,一進(jìn)動物體內(nèi)就失效了(如半衰期短、無法到達(dá)腫瘤部位、或去了不該去的器官產(chǎn)生毒性)。

為解決這個問題,Manifold Bio 開發(fā)了他們的核心平臺技術(shù) M-Code。

Manifold Bio 設(shè)計了一套極其穩(wěn)定的、非免疫原性的短氨基酸序列(蛋白質(zhì)片段)作為條形碼。這些條形碼可在小鼠血液和組織中長期存活,不會被降解,同時不會影響藥物本身的功能(不像某些大分子標(biāo)簽會改變藥物的折疊或結(jié)合能力)。

實(shí)驗結(jié)束后,通過質(zhì)譜分析(Mass Spectrometry)來讀取這些條形碼,從而區(qū)分不同的藥物分子。


有了M-Code,Manifold Bio的研發(fā)流程變成了:設(shè)計 100 種不同的抗體變體。給每個變體貼上一個獨(dú)特的 M-Code 條形碼,然后把這 100 種藥混合注射到同一只小鼠體內(nèi)。 一段時間后,取出小鼠的腫瘤組織、肝臟、腎臟等。

使用質(zhì)譜儀分析組織樣本,讀取其中的 M-Code。 科學(xué)家就可以立刻看到一張清晰的圖表:藥物 A 大量富集在腫瘤里(好藥!);藥物 B 全跑到了肝臟里(有毒性風(fēng)險,淘汰);藥物 C 在血液里代謝太快,沒起效(淘汰)。

Manifold Bio 技術(shù) 的核心價值在于數(shù)據(jù)更真實(shí),不需要先在培養(yǎng)皿里瞎猜,而是直接在動物體內(nèi)獲得最真實(shí)的藥代動力學(xué)(PK)和生物分布數(shù)據(jù)。特別適合開發(fā)復(fù)雜的藥物,如雙抗或ADC。 可在早期就通過體內(nèi)數(shù)據(jù)快速迭代藥物設(shè)計,而不是等到臨床前晚期才發(fā)現(xiàn)藥物在體內(nèi)分布不好。

03

臨床試驗AI公司,拓適應(yīng)癥

Formation Bio 是一家AI驅(qū)動的新型生物制藥公司,前身是 TrialSpark,后更名為 Formation Bio。


其他的 AI 制藥公司常側(cè)重于通過大模型進(jìn)行藥物設(shè)計和發(fā)現(xiàn),而 Formation Bio利用自己獨(dú)特的技術(shù)平臺和 AI 能力,從其他制藥公司收購處于臨床階段的候選藥物,然后更高效地推進(jìn)這些藥物的研發(fā)和臨床試驗流程,側(cè)重于臨床開發(fā)(Clinical Development)。

2024年,該公司獲得了C輪3.72億美元融資,并與 OpenAI 達(dá)成戰(zhàn)略合作,這使得它在 AI 制藥領(lǐng)域備受矚目。

他們找到那些在別的藥企手里可能被擱置、或者非核心資產(chǎn)但有潛力的處于臨床階段的藥物資產(chǎn)。然后,利用自建的技術(shù)平臺和 AI 引擎,重新設(shè)計試驗、優(yōu)化流程、加速患者招募和數(shù)據(jù)分析。 最終通過 FDA 批準(zhǔn)上市或出售給大型藥企獲利。

獨(dú)家的“數(shù)據(jù)+流程”閉環(huán) (Data & Process Feedback Loop)是他們最大的護(hù)城河。其它 AI 模型缺乏真實(shí)的臨床操作數(shù)據(jù)來訓(xùn)練,而 Formation Bio前身是做臨床試驗技術(shù)平臺的(TrialSpark),積累了大量的實(shí)際操作數(shù)據(jù)。

他們將 AI 嵌入到臨床試驗的每一個環(huán)節(jié)(從寫協(xié)議、招募患者到數(shù)據(jù)監(jiān)控)。真實(shí)世界的反饋數(shù)據(jù)會實(shí)時回傳給大模型,讓模型越來越聰明,形成“飛輪效應(yīng)”。

另外,F(xiàn)ormation Bio還是 OpenAI 在制藥領(lǐng)域的首個深度合作伙伴。他們可直接訪問 OpenAI 最頂尖的模型和資源,利用大語言模型(LLM)來處理海量的非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)(如醫(yī)生筆記、監(jiān)管文件、復(fù)雜臨床協(xié)議)。這能極大縮短編寫報告、分析副作用和合規(guī)檢查的時間。

他們還構(gòu)建了端到端的操作系統(tǒng)。 利用生成式 AI 自動起草臨床Protocol、知情同意書和監(jiān)管提交文件,將數(shù)周的工作縮短為數(shù)天;還利用 AI 快速篩選符合條件的患者,解決臨床試驗招募的痛點(diǎn)。AI還可以幫助團(tuán)隊判斷哪些藥物值得收購,預(yù)測成功率,從而降低投資風(fēng)險。


傳統(tǒng)藥物研發(fā)遵循“埃魯姆定律”(Eroom's Law),即研發(fā)成本越來越高,效率越來越低。Formation Bio代表了一種新范式,通過技術(shù)手段優(yōu)化流程管理和決策,大幅壓縮數(shù)年甚至十年的研發(fā)周期,降低成本。

如果這一模式跑通,他們將不僅僅是一家制藥公司,而是一個能批量生產(chǎn)新藥的高效工廠。

他們的核心競爭力在于極大幅度地提升臨床試驗的效率和成功率,并通過收購現(xiàn)有資產(chǎn)來實(shí)現(xiàn)快速變現(xiàn)。

胖貓的見解:

AI 制藥不再是簡單的提供一個算法,而是實(shí)現(xiàn)了“干濕閉環(huán)”。算法預(yù)測(干)+ 高通量驗證(濕)已成標(biāo)配。

在市場端,MNC不再追求買下 AI 軟件,而是通過“License-in AI-designed candidates”來對沖管線枯竭風(fēng)險。

在應(yīng)用場景上,GPCR 模擬、腦部遞送、臨床提效……AI 正在各個單點(diǎn)領(lǐng)域通過“暴力破解”實(shí)現(xiàn)超越。

有一點(diǎn)比較遺憾的是,很多傳統(tǒng)藥企手里攥著大量歷史臨床數(shù)據(jù),卻因沒有 AI 整合能力,導(dǎo)致這些數(shù)據(jù)在數(shù)據(jù)庫里“吃灰”,錯失了像 Formation Bio 這種重塑臨床流程的機(jī)會。

現(xiàn)在如果搞AI制藥,要 關(guān)注公司正在研發(fā)的具體分子(如Superluminal 的 MC4R 激動劑),而非僅僅看AI敘事。單純的藥物發(fā)現(xiàn)已經(jīng)過熱,像Manifold這種解決“如何送到靶區(qū)”的 AI 遞送技術(shù)才是稀缺資產(chǎn)。

也要琢磨下,是否有一些被大廠放棄、但在 AI 加持下可能有新轉(zhuǎn)機(jī)的“冷門管線”,效仿 Formation Bio的資產(chǎn)運(yùn)作模式,可能還有機(jī)會撿到大漏!

如果您喜歡胖貓的觀點(diǎn)和文字,歡迎加入胖貓的知識星球~

在這里我們?yōu)槟峁┥疃鹊馁Y料、工作工具、觀點(diǎn)見解~您也可以通過問答和胖貓以及各位同行進(jìn)行深度鏈接~

一起學(xué)習(xí)、進(jìn)步,搞錢~


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