諾貝爾化學獎今天開獎,結果搞計算生物學的先坐不住了。獎項拆成兩半:一半給華盛頓大學的David Baker,表彰他在計算蛋白質設計上的工作;另一半由谷歌DeepMind的Demis Hassabis和John Jumper共享,理由是"蛋白質結構預測"。
這是AlphaFold第二次在諾獎舞臺亮相。2020年它首次開源時,生物學家們還在爭論"這算工具還是算發(fā)現"。四年過去,這個爭論被110萬封郵件終結——全球研究者用AlphaFold預測了超過2億個蛋白質結構,相當于把人類積攢幾十年的實驗數據一夜攤平。
Baker的Rosetta軟件棧更早,但商業(yè)化路徑完全不同。他的公司們(包括最近的Xaira Therapeutics)累計融資超過10億美元,而DeepMind選擇免費開放數據庫。一位結構生物學家在獲獎后發(fā)了條推文:「我博士期間花兩年解一個結構,現在本科生點一下鼠標就行。」
頒獎詞里藏著一句潛臺詞。委員會特意提到AlphaFold"解決了50年的難題"——這50年指的是從1972年Christian Anfinsen獲獎(他提出氨基酸序列決定結構)到今天的空白。換句話說,兩次化學諾獎之間,隔著一個行業(yè)的集體焦慮。
Hassabis在發(fā)布會現場被問到"AI是否正在接管科學發(fā)現",他頓了一下說"我們只是提供了望遠鏡"。但望遠鏡不會自己申請專利,也不會讓制藥公司的結構生物學部門裁員30%。
最后一個細節(jié):Baker和DeepMind團隊至今沒有合作論文。兩個陣營的算法路線不同,數據集也互相獨立。諾獎委員會這次相當于把兩杯沒兌在一起的酒,強行倒進了一個杯子。
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