陜西
系列簡介
這是我們一系列原創技術貼，從易到難，每天學習一點。所有內容均為疾控數據分析、科研論文相關，或者說很多和現在的熱門監測預警相關，所以我們這個系列就叫“監測預警基礎”。
今天是第25節，再詳細講一下MEM的核心計算過程。
首先需要說明的是，一般情況下MEM的操作我們都是采用R或者類似軟件工具實現的，但是對于傳染病監測人員來說，直接使用R或在線工具雖然方便，但容易變成"黑箱操作"，就是不理解過程和原理，結果就出來了。
我們首先教大家用Excel手動計算，有三大好處：
深入理解原理：每個計算步驟都親手完成，真正掌握MAP函數的內涵
數據質量把控：在計算過程中能及時發現數據問題，確保結果可靠性
理解參數調整：便于理解δ參數等關鍵設置對結果的影響
今天，我們就以某區縣流感每周病例數為例，完整重現MAP函數的計算流程。
MAP函數的全稱是"最大累積和百分比"，它的作用是自動找出一個流行季中，病例數最集中的連續周次，從而確定流行期的長度和位置。
計算公式如下：
p_j^r = t_j^r ÷ t_j^S
其中：p_j^r就是MAP函數值；分子t_j^r是連續r周的最大發病數累積和；分母t_j^S是整個流行季發病數總累積和。
這個公式的意義在于通過計算不同r值對應的累積和占比，找到病例數增長最集中的時段。
一、第一步：準備基礎數據
比如有一個52周每一周的流感病例數這樣的數據
二、第二步：計算不同r值的累積和（分子t_j^r）
這是最關鍵的一步，我們需要計算連續1周、2周、3周...直到52周的最大發病數累積和。記住，是最大發病數累計和，不是第1周、第2周的累計和，而是連續r周，r是連續的周次，以1周、2周作為連續幾周算最大發病數累計和。
r=1，就是52周中某連續1周最大的發病數的累計和，其實就是最大發病數那一周，
r=2，就是52周中某連續2周最大的發病數的累計和，其實就是最大發病數那一周和它上下某一周的累計和，上下周中哪一周大就加那一周。
理解還是比較好理解的，但是操作起來很難，有什么便捷的操作技巧嗎？
當然有！使用下面這個公式即可
=MAX(SUBTOTAL(9, OFFSET($B$2, ROW($1:$52) - 1, 0, D2, 1)))
我們對公式說明解釋一下：
OFFSET($B$2, ROW($1:$52)-1, 0, D2, 1)：生成從每個起始周開始的連續 r周的數據范圍。
SUBTOTAL(9, ...)：計算每個范圍的求和（9表示求和功能）。
MAX(...)：取所有窗口累積和的最大值。
重要提示：此公式為數組公式，輸入后需按Ctrl+Shift+Enter確認（Excel會添加{}括號）。如果使用Excel 365或2021版，直接按Enter即可。
三、第三步：計算總累積和（分母t_j^S）
這是MAP函數的分母，總累計和其實就是1-52周病例數的和。
四、第四步：計算MAP函數值（p_j^r）
現在我們可以計算每個r值對應的MAP函數值了，其實就是分子除以分母。
五、第五步：計算P值斜率（Δp_j^r）
斜率計算是確定流行期長度的關鍵。
1.操作：
在H列計算斜率
在H2單元格輸入公式：
=(H3-H2)*100（轉換為百分比）拖動填充柄完成計算
注意最后一個r值（52）沒有斜率值
2.斜率的流行病學意義：
斜率代表病例數累積速度的變化
隨著r增大，斜率會逐漸減小
當斜率首次低于某個閾值（δ）時，就找到了最優流行期長度
δ參數是MEM模型的"調節器"，通常取值在2.0%-4.0%之間。初次計算可使用推薦值2.8%，如需優化，可在2.0%-4.0%間以0.1%為間隔測試，選擇靈敏度與特異度最均衡的值（約登指數最大）。
目前舉的例子中其實就是在H列（斜率列）中查找，找到第一個小于δ值的斜率對應的r值，本例中，當δ=2.8%時，r=14的斜率2.46%首次小于2.8%，因此確定流行期長度為14周。
七、第七步：確定流行開始和結束時間
找到流行期長度后，最后一步是確定具體的流行時間范圍，回到原始數據中第14周累積和的計算結果，找到累積和最大的連續14周時段究竟是哪個時段，這個時段就是流行期。
本例中，第19-32周的累積和3721為最大值，因此流行開始周為第19周，流行結束周為第32周；流行前期為第1-18周，流行后期為第33-52周。
好的，MEM的核心MAP函數我們就已經學會了，下一節我們講一講目標數據流行期閾值的設置。
編輯：普通疾控人 | 審核：詩酒趁年華
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