上海
撰文丨王聰
編輯丨王多魚
排版丨水成文
實(shí)驗(yàn)小鼠（laboratory mouse）是生物醫(yī)學(xué)研究中的關(guān)鍵模型系統(tǒng)，但其全身測量工具卻一直缺乏。
2026 年 3 月 27 日，復(fù)旦大學(xué)未來信息創(chuàng)新學(xué)院鮑峰青年研究員、芝加哥大學(xué)Nicolas Chevrier、北京航空航天大學(xué)人工智能學(xué)院Li Bohan等，在國際頂尖學(xué)術(shù)期刊Cell上發(fā)表了題為：Whole-body molecular and cellular mapping of the laboratory mouse 的研究論文。該研究成功繪制了實(shí)驗(yàn)小鼠的全身分子和細(xì)胞圖譜。
在這項(xiàng)最新研究中，研究團(tuán)隊生成了全小鼠切片的時空轉(zhuǎn)錄組學(xué)圖譜，能夠準(zhǔn)確捕捉組織學(xué)區(qū)域。研究團(tuán)隊通過構(gòu)建包含 5900 萬個單細(xì)胞的參考數(shù)據(jù)集，并結(jié)合一種可擴(kuò)展的細(xì)胞類型分配計算方法，在全小鼠切片圖譜中對 379 種細(xì)胞類型進(jìn)行了空間定位。此外，研究團(tuán)隊利用這些全小鼠圖譜創(chuàng)建了一個機(jī)器學(xué)習(xí)方法——LABEL，能夠?qū)碜?H&E 染色切片的組織學(xué)圖像進(jìn)行全身組織和細(xì)胞類型的注釋。
最后，研究團(tuán)隊將全小鼠空間分析應(yīng)用于內(nèi)毒素血癥（endotoxemia）中全身性炎癥的圖譜繪制，描繪了組織和細(xì)胞類型中基因表達(dá)程序的全組織變化。
該研究的亮點(diǎn)：
6 周齡小鼠全身切片的全轉(zhuǎn)錄組譜；
LABEL 算法在 H&E 圖像上標(biāo)注器官、組織和細(xì)胞類型；
全身圖譜揭示了小鼠內(nèi)毒素血癥的全身性炎癥特性；
該研究提供了一種在實(shí)驗(yàn)小鼠中開展全身空間分子研究的統(tǒng)一框架。
總的來說，這項(xiàng)工作為研究實(shí)驗(yàn)小鼠在空間、時間和條件下的分子和細(xì)胞過程的全身性研究鋪平了道路。
論文鏈接：
https://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(26)00273-4
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念洲
