基因組長達數(shù)百萬乃至數(shù)十億個堿基,難以一次性完整讀取,需打斷為小片段后測序、拼接、比對,最終重構(gòu)出完整的序列信息。根據(jù)測序平臺的不同,文庫構(gòu)建策略可分為二代測序(短讀長)與三代測序(長讀長)兩大類。三代測序因讀段更長,在檢測復(fù)雜結(jié)構(gòu)變異、串聯(lián)重復(fù)序列及 DNA 甲基化等方面優(yōu)勢顯著,廣泛應(yīng)用于遺傳病、腫瘤研究等領(lǐng)域。但其成本高、通量有限,靶向富集特定區(qū)域成為平衡成本與數(shù)據(jù)深度的關(guān)鍵策略。
如何將成熟的二代靶向捕獲方案,運用至三代測序平臺?如何在一次實驗中同步獲取甲基化信息與全長轉(zhuǎn)錄本數(shù)據(jù)?如何從微量樣本出發(fā),實現(xiàn)高效、高覆蓋的靶向三代測序?
4 月 16 日 14:00~16:00,安捷倫帶來題為「跨越壁壘,解鎖三代測序新應(yīng)用」的線上主題講座,特邀東京大學(xué) Masahide Sato 教授,他將以詳細的濕實驗驗證數(shù)據(jù)與生信分析結(jié)果,展示該技術(shù)如何在癌癥耐藥機制研究、表觀遺傳分析(甲基化檢測)、全長轉(zhuǎn)錄本測序、以及微量樣本(低至 10 ng gDNA)的靶向測序等場景中實現(xiàn)突破性應(yīng)用,為三代測序在復(fù)雜疾病研究中的落地提供切實可行的方案。現(xiàn)在報名,還有機會贏取 Tomtoc 電腦包,充電兩用護眼臺燈,定制 U 盤等 80 份好禮!
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這些突破性應(yīng)用得以實現(xiàn),離不開穩(wěn)定可靠的工具 :
SureSelect 靶向捕獲系統(tǒng):經(jīng)實驗驗證的跨平臺(二代/三代)富集工具
安捷倫 SureSelect XT HS2 靶向富集系統(tǒng)基于液相雜交捕獲原理,其探針原本為短讀長測序平臺設(shè)計。通過簡單調(diào)整實驗操作,無需重新設(shè)計探針即可用于長片段靶向捕獲,顯著降低方法開發(fā)成本。優(yōu)化后可獲得插入片段長度約 5 kb 的靶向序列捕獲文庫,在納米孔測序中展現(xiàn)出良好的靶標命中率與覆蓋度。無論是 DNA 甲基化靶向測序,還是空間轉(zhuǎn)錄組靶向分析,SureSelect 均提供從樣本制備、探針定制到數(shù)據(jù)分析的一體化解決方案,助力科研人員突破二代測序瓶頸,解鎖三代測序的深層應(yīng)用。
「NGS 靶向捕獲測序雖已廣泛應(yīng)用于臨床遺傳病診斷過程中,但受限于短讀長的先天不足,對許多疾病變異位點尚不能進行準確檢測,需要配合其他技術(shù)進行補漏,比如脆性 X 綜合征這類以短串聯(lián)核苷酸重復(fù)擴增引起的疾病,以及 α 地貧這類受同源序列嚴重干擾的疾病。長讀長測序可以有效解決 NGS 在檢測這些變異時的不足,提高檢測效率和臨床獲益,非常期待基于此技術(shù)的 WES 應(yīng)用報告。」
--安捷倫基因組學(xué)產(chǎn)品經(jīng)理
「短讀長目標區(qū)域捕獲測序已經(jīng)成熟應(yīng)用超過 15 年,隨著三代測序(長讀長)測序技術(shù)越來越成熟,針對長讀長的目標區(qū)域捕獲測序的需求也日益顯現(xiàn),尤其是長讀長目標區(qū)域捕獲測序能夠解決一些短讀長測序解決不了的問題,如串聯(lián)重復(fù)區(qū)域或者相關(guān)基因的測序與拼接檢測,結(jié)構(gòu)變異,目標全長轉(zhuǎn)錄本的測序與拼接等,該應(yīng)用簡報提供了一種基于 Agilent SureSelect 目標區(qū)域捕獲技術(shù)方案優(yōu)化的針對長讀長的目標區(qū)域捕獲測序方法,為相關(guān)臨床研究及科研工作者提供了有利的技術(shù)方法。」
--安捷倫基因組學(xué)應(yīng)用工程師
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