單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)深刻地改變了科研模式。隨著技術(shù)的推廣,單細(xì)胞數(shù)據(jù)挖掘已經(jīng)從早期的圖譜構(gòu)建過渡到聚焦特定的細(xì)胞類型,挖掘驅(qū)動(dòng)表型的核心基因,探究細(xì)胞互作模式等,這對(duì)于理解生物學(xué)過程、疾病診治、藥效預(yù)測(cè)以及免疫療法的靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)等具有重要意義。
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2026年3月,Nature Immunology期刊發(fā)表題為Chemokine-defined macrophage niches establish spatial organization of tumor immunity的研究論文。該研究結(jié)合了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、空間轉(zhuǎn)錄組和新抗原疫苗模型等,徹底打破長(zhǎng)期以來對(duì)腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞(TAMs)的認(rèn)知,即簡(jiǎn)單地將CD206+視為促癌的M2型巨噬細(xì)胞。
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研究發(fā)現(xiàn),在肺癌微環(huán)境中,傳統(tǒng)的促腫瘤標(biāo)記物CD206,實(shí)際上標(biāo)記了兩群截然不同的細(xì)胞。高表達(dá)CD206的組織駐留型巨噬細(xì)胞(IMs)竟然是抗腫瘤的,而低表達(dá)CD206的才是促腫瘤的,或者與招募來的巨噬細(xì)胞(recMacs)混雜在一起。
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作者沒有停留在測(cè)序數(shù)據(jù)上,而是利用 Pf4-Cre Cx3cr1-DTR 小鼠模型,特異性清除了CD206高表達(dá)的組織駐留型巨噬細(xì)胞(IMs)。結(jié)果腫瘤負(fù)擔(dān)暴增,直接證明了這群細(xì)胞在體內(nèi)發(fā)揮抗腫瘤的作用。
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利用10x Xenium空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù),作者繪制了巨噬細(xì)胞圖譜。發(fā)現(xiàn)CD206高表達(dá)的組織駐留型巨噬細(xì)胞在血管旁(抗腫瘤免疫前線)。機(jī)制研究則發(fā)現(xiàn),組織駐留型巨噬細(xì)胞在腫瘤區(qū)域“被迫”或“異常”地分泌CCL2,從而招募血液里的促腫瘤的巨噬細(xì)胞。
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我們用的AI工具,有點(diǎn)智障,湊合看了
先借助單細(xì)胞和空間組數(shù)據(jù)分析鑒定到特定的細(xì)胞類群,然后通過免疫熒光技術(shù)等從蛋白層面證實(shí)特定細(xì)胞類群的表型和功能,如果還有敲除和/或過表達(dá)的體外和體內(nèi)實(shí)驗(yàn),以及機(jī)制研究、轉(zhuǎn)化研究,那就更完美了。
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