人類巨細(xì)胞病毒(HCMV)是一種非常常見的病毒,很多人在嬰幼兒時期就已經(jīng)感染,但它通常不會引起明顯癥狀,而是悄悄“潛伏”在體內(nèi),一旦人體免疫力下降,就有可能“激活”,引發(fā)健康問題。近年來,科學(xué)家們注意到,新冠病毒(SARS-CoV-2)感染后,有些患者體內(nèi)的HCMV會被重新激活,但背后的原因一直不清楚。
2025年7月16日,暨南大學(xué)陳俊,聯(lián)合江漢大學(xué)萬品和武漢輕工大學(xué)曾馳共同通訊在PlosPathogens在線發(fā)表題為“SARS-CoV-2 encoded ORF3a interacts with YY1 to promote latent HCMV reactivation”的研究型論文,該研究發(fā)現(xiàn)SARS-CoV-2的ORF3a蛋白可以通過與MIEP抑制因子YY1相互作用,激活HCMV的MIEP。這種相互作用導(dǎo)致YY1發(fā)生依賴泛素的降解,進(jìn)而促進(jìn)潛伏HCMV的再激活以及病毒的復(fù)制和增殖。這些發(fā)現(xiàn)揭示了SARS-CoV-2與HCMV在共感染過程中相互作用的分子機(jī)制,為未來預(yù)防和治療這兩種病毒共感染提供了新的理論基礎(chǔ)。
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促進(jìn)MIEP激活的SARS-CoV-2蛋白的篩選
為探究SARS-CoV-2誘導(dǎo)HCMV再激活的機(jī)制,研究者利用雙熒光素酶報(bào)告系統(tǒng)對SARS-CoV-2編碼蛋白進(jìn)行篩選,發(fā)現(xiàn)ORF3a、ORF7b和M蛋白均可顯著增強(qiáng)HCMV主要即刻早期啟動子(MIEP)的轉(zhuǎn)錄活性。
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圖1.促進(jìn)MIEP激活的SARS-CoV-2蛋白的篩選
進(jìn)一步的劑量依賴實(shí)驗(yàn)顯示,三種蛋白對MIEP活性的促進(jìn)作用與表達(dá)量呈正相關(guān)。結(jié)果表明,這些SARS-CoV-2蛋白可能在病毒共感染中誘導(dǎo)HCMV潛伏病毒的再激活。
SARS-CoV-2 ORF3a與YY1相互作用
通過篩選發(fā)現(xiàn),SARS-CoV-2的ORF3a、ORF7b和M蛋白均可激活HCMV MIEP。為進(jìn)一步探究其機(jī)制,作者重點(diǎn)檢測了這些蛋白與已知調(diào)控MIEP的轉(zhuǎn)錄因子(如YY1、NF-κB、AP-1)間的相互作用。免疫共沉淀(Co-IP)實(shí)驗(yàn)顯示,ORF3a能與轉(zhuǎn)錄抑制因子YY1形成復(fù)合物,而ORF7b和M蛋白未檢測到直接結(jié)合。免疫熒光共定位實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步證實(shí),ORF3a與YY1在細(xì)胞內(nèi)共定位,且ORF3a促使YY1從核內(nèi)轉(zhuǎn)移至胞漿。雙向Co-IP驗(yàn)證了ORF3a與YY1的互作關(guān)系,該互作同樣在SARS-CoV-2感染的THP-1衍生巨噬細(xì)胞中得到確認(rèn)。
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圖2.SARS-CoV-2的ORF3a與YY1相互作用
結(jié)構(gòu)域功能分析表明,ORF3a與YY1的相互作用依賴于YY1的轉(zhuǎn)錄激活域(1-154氨基酸)和鋅指DNA結(jié)合域(296-414氨基酸)。綜上,ORF3a通過結(jié)合YY1影響其細(xì)胞定位和功能,可能是調(diào)控HCMV MIEP活性及潛伏病毒再激活的關(guān)鍵機(jī)制之一。
ORF3a恢復(fù)了YY1抑制的MIEP活性
作者首先驗(yàn)證了YY1對HCMV MIEP的抑制作用:隨著Flag-YY1表達(dá)量增加,MIEP活性逐漸降低。進(jìn)一步探究ORF3a的作用時,發(fā)現(xiàn)隨著ORF3a表達(dá)量增加,YY1對MIEP的抑制作用逐漸減弱,同時免疫印跡顯示YY1蛋白水平下降。使用缺失YY1結(jié)合位點(diǎn)的MIEP突變質(zhì)粒(pGL3-MIEPmut)時,ORF3a對MIEP活性的調(diào)控喪失,提示ORF3a對MIEP的激活依賴于YY1及其結(jié)合位點(diǎn)。
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圖3.ORF3a可恢復(fù)YY1對MIEP活性的抑制作用,并呈劑量依賴性
此外,敲低YY1表達(dá)可促進(jìn)MIEP活性,但此時ORF3a的促進(jìn)作用消失,進(jìn)一步說明ORF3a依賴YY1介導(dǎo)MIEP調(diào)控。競爭性表達(dá)缺失轉(zhuǎn)錄抑制結(jié)構(gòu)域的YY1Δ2突變體能結(jié)合ORF3a但無法抑制MIEP活性,且恢復(fù)野生型YY1后抑制作用得以重建,證明ORF3a通過與YY1相互作用解除其對MIEP的抑制。綜上,ORF3a通過與YY1結(jié)合并降低其抑制活性,促進(jìn)HCMV MIEP的激活,可能驅(qū)動潛伏病毒的再激活。
ORF3a促進(jìn)YY1的泛素依賴性蛋白酶體降解
確認(rèn)SARS-CoV-2 ORF3a與YY1在宿主細(xì)胞中相互作用后,作者進(jìn)一步探討了ORF3a對YY1的影響。隨著ORF3a表達(dá)量增加,293T細(xì)胞中YY1蛋白水平逐漸降低;在感染SARS-CoV-2的巨噬細(xì)胞中亦觀察到Y(jié)Y1顯著下降,敲低ORF3a后YY1表達(dá)恢復(fù)正常,提示ORF3a促進(jìn)YY1降解。
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圖4.SARS-CoV-2的ORF3a促進(jìn)YY1的泛素化降解
免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)結(jié)合泛素標(biāo)記顯示,ORF3a顯著促進(jìn)了YY1的泛素化修飾。使用蛋白酶體抑制劑MG132能夠阻斷ORF3a介導(dǎo)的YY1降解,而溶酶體抑制劑NH4Cl無效,表明該降解依賴蛋白酶體途徑。
進(jìn)一步敲低E3泛素連接酶TRIM59或TRAF3發(fā)現(xiàn),只有TRIM59缺失阻斷了ORF3a誘導(dǎo)的YY1降解。在SARS-CoV-2感染的巨噬細(xì)胞中,TRIM59敲低也恢復(fù)了YY1蛋白水平。綜上,ORF3a通過與E3連接酶TRIM59相互作用,促進(jìn)YY1的泛素依賴性蛋白酶體降解。
SARS-CoV-2 ORF3a促進(jìn)HCMV從潛伏期重新激活
除此之外,研究利用THP-1細(xì)胞建立HCMV潛伏模型,結(jié)合ORF3a的穩(wěn)定表達(dá),發(fā)現(xiàn)ORF3a促進(jìn)了HCMV主要即刻早期基因(IE1/IE2)的表達(dá),加快了病毒從潛伏期向活躍復(fù)制的轉(zhuǎn)變。RT-qPCR和Western blot結(jié)果均顯示,ORF3a表達(dá)使IE1/IE2轉(zhuǎn)錄及蛋白水平在TPA誘導(dǎo)的巨噬細(xì)胞分化過程中顯著升高,同時YY1蛋白水平明顯下降,但其mRNA水平無顯著變化,提示ORF3a通過促進(jìn)YY1蛋白降解激活MIEP。
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圖5.SARS-CoV-2的ORF3a促進(jìn)HCMV從潛伏期再激活
在SARS-CoV-2與HCMV共感染模型中,敲低ORF3a可恢復(fù)YY1蛋白表達(dá),抑制HCMV再激活和復(fù)制,且ΔORF3a突變的SARS-CoV-2病毒增強(qiáng)HCMV IE1/IE2表達(dá)及復(fù)制能力明顯減弱。以上結(jié)果表明,SARS-CoV-2 ORF3a通過介導(dǎo)YY1降解,解除其對HCMV MIEP的抑制,從而促進(jìn)潛伏HCMV的再激活和病毒復(fù)制。
綜上所述,本研究首次揭示了SARS-CoV-2蛋白ORF3a通過與轉(zhuǎn)錄抑制因子YY1相互作用,促進(jìn)其泛素依賴性降解,從而激活HCMV主要即刻早期啟動子(MIEP),促進(jìn)潛伏HCMV的再激活。該機(jī)制為SARS-CoV-2與HCMV共感染過程中病毒相互作用提供了分子基礎(chǔ),強(qiáng)調(diào)了ORF3a作為潛在治療靶點(diǎn)的重要性。未來研究需建立更具生理相關(guān)性的模型,深入探索SARS-CoV-2共感染引發(fā)HCMV再激活的多因素調(diào)控機(jī)制,并評估其在COVID-19長期并發(fā)癥中的作用,為臨床干預(yù)提供新思路。
原文鏈接:https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1013344
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