一篇文章被質疑其發現的新細胞根本不存在，隨后被Nature撤稿

2025年7月9日，在作者反對的情況下，《Nature》撤回了一篇發表于2022年的關于髓母細胞瘤細胞起源的論文，因為另一獨立研究團隊進行的重新分析對該論文的關鍵發現提出了質疑。重新分析文章作為“Matters Arising”類型的文章，與撤稿通知同時發表。

Matters Arising：通常指的是針對已發表論文的正式評論或質疑，需經過同行評審，以確保學術質量和準確性。

圖.撤稿文章

鏈接：https://www.《Nature》.com/articles/s41586-022-05487-2

這篇已被撤稿的論文，通過對人類胎兒小腦進行單細胞測序，鑒定出一種此前未知的過渡性小腦祖細胞（transitional cerebellar progenitor, TCP）。該試驗由兒科學教授Q. Richard Lu主導。論文中，髓母細胞瘤樣本的單細胞分析顯示“TCP細胞的比例大幅增加”，這表明這些細胞可能參與了癌癥的發展。根據Web of Science數據，該論文已被引用27次。

圖.重新分析的文章

鏈接：https://www.《Nature》.com/articles/s41586-025-09247-w

重新分析顯示，這種細胞類型可能根本不存在。這項重新分析由Paul Northcott主導。論文中，該團隊表示在一份獨立的小腦分析圖譜中未能找到這種細胞存在的證據；而且在Q. Richard Lu的原始圖譜數據中，被視作TCP標記基因的HNRNPH1、SOX11和CTNNB1在“TCP和非TCP細胞中的比例相似”。

此外，2022年研究中，TCP細胞“檢測轉錄本的核比例很低”，獨特的分子標識符（unique molecular identifier）計數也很低。重新分析指出，這些特征“與環境RNA污染情況一致，這種污染主要來自單個供體”。

圖.撤稿聲明

鏈接：https://www.《Nature》.com/articles/s41586-025-09015-w

撤稿通知指出，對TCP細胞證據不足的擔憂引起了編輯關注。發表后同行評審“對論文一個關鍵的結論提出了質疑”，從而撤回了該文章。

撤稿論文的作者Q. Richard Lu表示，他和其他作者均不認可這篇重新分析的發現，也不同意《Nature》的撤稿決定。他認為這些爭議“屬于學術規范的范疇”，還沒有到需要撤稿的地步。他強調“這是一場學術爭論，而不是犯的錯誤” 。

Q. Richard Lu表示，《Nature》在2023年4月告知他重新分析的文章對他研究結果的質疑。隨后，他和同事們做了進一步的實驗和分析，提交了一份“回復”（Reply），但2024年11月，《Nature》通知他不會發表這份“回復”并計劃撤稿。2025年6月，他將這份“回復”作為預印本發布在bioRxiv上。

圖. 發表到預印本的回復

鏈接：https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2025.06.01.657310v4

預印本的這篇回復指出，獨立的小腦圖譜分析確實驗證了TCP細胞的存在。他們分析了與Paul Northcott團隊相同的圖譜，并鑒定出了高度富集SOX11和HNRNPH1的細胞類型，預印本稱這“證實了類似TCP細胞群的存在”。

此外，Q. Richard Lu團隊對原始數據集進行重新分析時，使用了更嚴格的數據截斷值（cut-off）以排除環境RNA污染，最后仍然得出結論：TCP細胞具有一組“由顯著富集的標記基因” 為標志的獨特轉錄特征。

Q. Richard Lu在2025年6月致信給出版倫理委員會（COPE），要求進行獨立審查，以確定《Nature》的撤稿流程是否“遵循了COPE指南和最佳編輯實踐”。

他表示，現在并沒有發現嚴重到需要撤稿的“證據確鑿”的錯誤，如果存在這種足以改變結論的錯誤，他會主動撤回該研究。

·關于Q. Richard Lu：

本文撤稿論文為Q. Richard Lu的第二次撤稿。

2022年，《Cell Death & Disease》曾撤回了一篇2017年發表的論文，撤稿原因為多個圖表中存在“重復特征”。Q. Richard Lu是這篇論文的合著者之一，對此，他表示自己不是這項研究的主要研究者，對這些圖表并不知情。

此外，Q. Richard Lu及其同事糾正了2009年發表在《Nature Neuroscience》上的一項研究，該研究的一張圖表存在“非故意的重復”。2025年6月，學術偵探Elisabeth Bik在PubPeer上指出這一問題。

文章整理自：https://www.thetransmitter.org/cell-types/《Nature》-retracts-paper-on-novel-brain-cell-type-against-authors-wishes/